糞污全量還田模式
養殖場產生的糞便、尿和污水集中收集，全部進入氧化塘貯存，氧化塘分為敞開式和覆膜式兩類，糞污通過氧化塘貯存進行無害化處理，在施肥季節進行農田利用。
主要優點：糞污收集、處理、貯存設施建設成本低，處理利用費用也較低；糞便和污水全量收集，養分利用率高。
主要不足：糞污貯存周期一般要達到半年以上，需要足夠的土地建設氧化塘貯存設施；施肥期較集中，需配套專業化的攪拌設備、施肥機械、農田施用管網等；糞污長距離運輸費用高，只能在一定范圍內施用。
適用范圍：適用于豬場水泡糞工藝或奶牛場的自動刮糞回沖工藝，糞污的總固體含量小于15%；需要與糞污養分量相配套的農田。
糞便好氧堆肥模式
以生豬、肉牛、蛋雞、肉雞和羊規模養殖場的固體糞便為主，經好氧堆肥無害化處理后，就地農田利用或生產有機肥。
主要優點好氧發酵溫度高，糞便無害化處理較徹底，發酵周期短；堆肥處理提高糞便的附加值。
主要不足好氧堆肥過程易產生大量的臭氣。
適用范圍適用于只有固體糞便、無污水產生的規模化肉雞、蛋雞或羊場等。
糞污厭氧處理模式
以專業生產可再生能源為主要目的，依托專門的畜禽糞污處理企業，收集周邊養殖場糞便和污水，投資建設大型沼氣工程，進行高濃度厭氧發酵，沼氣發電上網或提純生物天然氣，沼渣生產有機肥農田利用，沼液農田利用或深度處理達標排放。
主要優點：對養殖場的糞便和污水集中統一處理，減少小規模養殖場糞污處理設施的投資；專業化運行，能源化利用效率高。
主要不足：一次性投資高；能源產品利用難度大；沼液產生量大、集中，處理成本較高，需配套后續處理利用工藝。
適用范圍：適用于大型規模養殖場或養殖密集區，具備沼氣發電上網或生物天然氣進入管網條件，需要地方政府配套政策予以保障。
糞水肥料利用模式
養殖場產生的污水厭氧發酵或氧化塘處理儲存后，在農田施肥和灌溉期間，將無害化處理的污水與灌溉用水按照一定的比例混合，進行水肥一體化施用，固體糞便進行堆肥發酵就近肥料化利用或委托他人進行集中處理。
主要優點：污水進行厭氧發酵或氧化塘無害化處理后，為農田提供有機肥水資源，解決污水處理壓力。
主要不足：要有一定容積的貯存設施，周邊配套一定的農田面積；需配套建設糞水輸送管網或購置糞水運輸車輛。
適用范圍:適用于周圍配套有一定面積農田的規模豬場或奶牛場，在南方宜使用厭氧發酵生產沼氣等無害化處理，在北方宜直接使用氧化塘貯存，在農田作物灌溉施肥期間進行水肥一體化施用。
